Здравствуйте)
Ваши сообщения увидела лишь вчера, хотя они датированы 13.07
С ваших слов он нормально себя ощущает когда есть стабильность (вы вместе, папа привычно на работе, в туалете и тд )
Дети такого возраста еще не умеют строить отношения втроем, где один может делать что-то одно, другие другое. Из-за этого ему и может быть сложно, когда картинка распадается. И он начинает сильно тревожиться, пытаясь "собрать" все назад.
Это может пройти само со временем, как в случае с вами (вы описали, как он волновался, когда вы уходили).
Пробуйте играть , например в прятки в комнате, где один прячется и его как бы нет, а потом обязательно появляется. Далее, прячущийся может уже прятаться вне комнаты. Тут уж и недалеко до ухода по делам в квартире.
Стоит так же успокаивать и сообщать, кто куда пошел, внося понимание и стабильность ребенку.
По вашим словам , сын упрям и достаточно тревожен и ему трудно даются ситуации, связанные с изменениями. Связано ли это лишь с возрастом, однозначно сложно сказать.
В этом вопросе что-то может зависеть от отношений с ним близких, например. Если это будет продолжать вас волновать, можно организовать очную встречу.