Не шпаклевкой!!!!!! А специально предназначенным именно для этих целей герметиком!!!!!!!!
По опыту только он держится в щелях и "играет" вместе с деревом. Его придумали именно для этого. После высыхания он как резина...
Любая шпаклевка по дереву высыхает, трескается и высыпается.