при необходимости суд или трудовая инспекция запросит копию вашего трудового договора от организации -это как вариант.
Согласно ТК, работодатель обязан по письменному заявлению работника выдать копии документов, связанных с работой, в трехдневный срок. вы можете написать такое заявление, обязательно его зарегистрировать, этого будет достаточно для труд.инспекции, даже если копию вам не выдадут..
если у вас есть "черные" ведомости на руках, или штатное расписание с подписью руководства, или еще акие- либо документы - сможете доказать. При этом к Вам вероятно будут претензии со стороны налоговых органов - вы ведь налог платили не со всех своих доходов, а только с белой части.