По словам сотрудника Яндекса, с которым мы как-то разговаривали на эти темы (разговор вышел случайный, за кофе на мероприятии - за что купил, за то и продаю).
Эконому Яндекс просто предоставляет услуги агрегатора. Комфорт и комфорт+ - сопровождает с процесной и кадровой точки зрения (т.е. проводит аудиты, собеседования с шоферами и так далее).
Персонально, в экономе не езжу уже очень давно, с комфортом проблем не было.